巢纪平论文选集记载了巢院士风雨六十年的多篇论文, 第一部分数值预报, 放了两篇文章, 代表一个预报业务化时代的开始。选集的第二部分, 安排了中小尺度系统。第三部分是长期数值预报, 第四部分是大气和海洋动力学。第五部分热带运动和海气相互作用, 笫六部分涉及用动力学和热力学方法来研究荒漠化、城市化。