实验内容主要分为以下三大部分：第一章微生物生态学多样性研究、第二章环境微生物宏基因组学研究和第三章环境微生物蛋白与代谢组学研究。通过本书可以让学生更好的理解微生物生态学实验相关理论知识，掌握环境微生物实验操作技能，明确环境微生物学的专业特色，从而培养学生对科学研究的兴趣和创新思维，提高学生的专业能力和实践能力。